6号展厅-深蓝宝藏——南海西北陆坡一二号沉船考古成果特展
7号展厅-做海——南海渔家文化展（海南）
1、2号展厅-南海人文历史陈列
3号展厅-八百年守候——西沙华光礁Ⅰ号沉船特展
5号展厅-探海寻踪——中国水下考古与南海水下文化遗产保护
10号展厅-南海自然生态陈列